青い文字は部屋の名前、緑の線は扉を表しています。赤い番号は、見取り図の下の説明の番号に対応しています。各見取り図の解説は、書かれている文字が見えないように作ってあります。見たい部分をドラッグして、必要な部分だけご覧になってください。
1. クレーンを動かす装置。動かすためにはカギが必要。 → 「緑川執務室（地下１階）」で入手できる『クレーンの鍵』を使用する。
2. 警備システム。『セキュリティーカード』が必要。 → 「見学スペース（地下３階）」で入手できる『セキュリティーカード』を使用する。
3. 最初はシャッターが下りていて入ることができない。開けるためには『クランク』が必要。 → 地下２階のエレベーターの近くで入手できる『クランク』を使用する。
4. 部屋の奥にノートパソコンが置いてあるが『バッテリー』がないと使えない。 → 「機材倉庫（地下２階）」の奥で入手できる『バッテリー』を使用する。
5. 部屋の奥にユリの絵が飾ってある。調べると隠し金庫があるが、カギでは開けられない。 → 「解剖手術室（地下３階）」で入手できる『亜門のＤＮＡサンプル』を使用して金庫を開けると『二階堂のＤＮＡサンプル』と『スティックキーＴ』を入手できる。
6. 最初はロックされていて入れない。テンキーとスロットがある。 → 比奈ハッカー（パソコン）を使用してパスワードを解析するとロックが解除される。
7. スナップ写真が飾ってある。
8. 机の引出しを開けるために、パスワードが必要。 → ［ヒント］スナップ写真に書かれていたメッセージは？（パスワードは４文字） → パスワード（４文字）を入力すると、引出しを開けることができ、『スティックキーＡ』と『クレーンの鍵』を入手できる。
9. 『電源ケーブル』が切られている。このままでは使えない。 → 「リフレッシュルーム（地下２階）」で入手できる『電源ケーブル』を使用する。 → 電話の「亜門」「緑川」「I.N」「実川」のボタンを押すと、それぞれのプッシュ音を聞くことができる。
10. ホワイトボードに塩基配列の法則が書いてある。
11. 奥に「亜門」「緑川」「I.N」「実川」のロッカーがあり、パスワードを入力すると開けることができる。 → 「プレゼンテーションルーム（地下１階）」にある電話の「亜門」「緑川」「I.N」「実川」のボタンを押し、どの数字や記号が、どんな順番に押されているのかを推理する。その数字や記号がロッカーのパスワードとなる。 → 「I.N」のロッカーから『スティックキーＣ』『二階堂の日記』、「緑川」のロッカーから『セーフティロック』を入手できる。
12. 最初はエレベーターが上に戻っていて使えない。